教員総覧 - 齋藤　徹 | 広島市立大学

（最終更新日 : 2024-09-27 07:36:40）

サイトウ　トオル XXX
齋藤　徹

所属広島市立大学大学院情報科学研究科医用情報科学専攻

広島市立大学情報科学部医用情報科学科

職種准教授

メールアドレス

職歴
2023/04/01 ～	広島市立大学大学院情報科学研究科医用情報科学専攻准教授
2023/04/01 ～	広島市立大学情報科学部医用情報科学科准教授
2019/04 ～ 2023/03	広島市立大学大学院情報科学研究科　医用情報科学専攻講師
2016/04 ～ 2019/03	広島市立大学大学院情報科学研究科　医用情報科学専攻助教
2014/05 ～ 2016/03	大阪大学大学院理学研究科　化学専攻招へい研究員(兼任)
全件表示（8件）

学歴
2012/03/22 (学位取得)	博士（理学）
2009/04～2012/03	大阪大学理学研究科化学専攻博士後期課程修了
2009/03/24 (学位取得)	修士（理学）　　　学位記受領代表者
2007/04～2009/03	大阪大学理学研究科化学専攻博士前期課程修了
2003/04～2007/03	大阪大学理学部化学科卒業

教育・研究活動状況
【教育活動】医用情報科学の分野では、情報科学に加えて自然科学の知識も必要となリます。最先端の研究内容やノーベル賞を受賞した研究の何が秀でているのかを例にあげながら、学部学生に興味を持ってもらうよう講義することに努めています。また、科学技術英語の文章構成をもとに、日本語・英語を問わず、相手に伝わりやすい論理的な文章を書く力を養成することにも注力しています。【研究活動】医薬品をはじめとする機能性物質の設計には多くの時間と費用が必要です。事前にコンピュータを使ったシミュレーションを行えば、それらを大幅に削減できる可能性がありますが、簡単にかつ正確に予測できるまでには至っていません。この問題の解決をするために、計算精度を維持したまま計算コストを大幅に削減できるシミュレーション方法を考案、開発し、薬物代謝部位、DNA損傷、薬剤とタンパク質との相互作用の予測の研究を行っています。 (Education for undergraduates) I try as hard as possible to increase students’ interest in natural science, which is a base of the biomedical information sciences. Course materials provided to students are latest scientific research news including the Nobel prizes in physiology and medicine, chemistry, and physics. I briefly explain the reasons why these studies are marked as scientific breakthroughs. Emphasis is also placed on education to improve how to write logical and readable sentences by means of analyzing scientific articles written in English. (Research) It takes much time and money to design new functional materials such as drugs. Computer-aided materials design is of great interest to industrial and pharmaceutical fields, but it is still impossible to achieve the optimal balance of computational costs and accuracy. I devise a new approach, which substantially reduces computational costs without deteriorating the accuracy. To illustrate the merits of the method, it is now applied to the prediction of site of metabolism, oxidative DNA damage, and drug-protein interactions.

現在の専門分野
基礎物理化学, 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理, 薬系分析、物理化学キーワード(金属酵素、酸化反応、強相関電子系、半経験的分子軌道法、多階層シミュレーション)

研究テーマ
2022/04/01	半経験的量子化学計算と機械学習を併用した反応性・物性の予測
2016	新規医薬品設計を目指した簡便かつ精確な計算手法の開発
2012	多階層計算手法による金属酵素の触媒機構の解明
2007	近似スピン射影法の高精度波動関数理論や構造最適化計算への拡張

研究課題・受託研究・科研費
2024/04/01 ～ 2027/03/31	酸化還元酵素の阻害活性予測モデルの開発基盤研究(C)
2022/04/01 ～ 2023/03/31	生体分子シミュレーションを用いたウレアーゼ阻害剤の設計 * 公益財団法人サタケ技術振興財団 2022年度大学研究助成金
2021/04/01 ～ 2024/03/31	金属酵素の酵素反応機構およびリガンド相互作用の定量的解明基盤研究(C)
2019/02/07 ～ 2022/03/31	生体分子中の窒素の特性を，中性子回折と計算化学により解明する国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
2018/04/01 ～ 2019/03/31	新規医薬品設計に向けた薬物代謝反応の計算化学的研究 * 公益財団法人サタケ技術振興財団　平成30年度　大学研究助成金
全件表示（9件）

著書・論文歴
著書	Approximate spin projection for broken-symmetry method and its application" in Symmetry (Group Theory) and Mathematical Treatment in Chemistry (共著) 2018
著書	Calculation of Magnetic Properties and Spectroscopic Parameters of Manganese Clusters with Density Functional Theory” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics (共著) 2012
著書	Density Functional Study of Manganese Complexes: Protonation Effects on Geometry and Magnetism” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics (共著) 2012
著書	Electronic and Spin Structures of the CaMn4O5(H2O)4 Cluster in OEC of PSII Refined to 1.9 Å X-ray Resolution" Advances in Quantum Chemistry (共著) 2012
著書	“Approximate Spin Projection for Geometry Optimization of Biradical Systems: Case Studies of Through-Space and Through-Bond Systems” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics (共著) 2012
全件表示（100件）

学会発表
2023/11/20	半経験的手法と機械学習を併用した薬物代謝部位予測 (第51回構造活性相関シンポジウム)
2023/11/12	QM/MM-MD計算によるDNA塩基対の二重プロトン移動の機構解明 (日本化学会中国四国支部大会山口大会)
2023/11/11	IDO1 阻害剤設計のためのケモインフォマティクス記述子の検討 (日本化学会中国四国支部大会山口大会)
2023/11/11	機械学習による C-H 活性化反応の反応速度の予測 (日本化学会中国四国支部大会山口大会)
2023/11/11	半経験的手法と機械学習を併用したアルデヒドオキシダーゼ代謝部位予測 (日本化学会中国四国支部大会山口大会)
全件表示（137件）

受賞学術賞
2024/03/22	指導学生の受賞：最優秀修士学位論文賞「量子化学計算と機械学習を併用した薬物代謝部位予測法の開発」
2024/03/22	指導学生の受賞：最優秀卒業論文賞　「量子化学計算と機械学習を併用した反応速度定数の予測」
2023/03/23	指導学生の受賞：最優秀卒業論文賞　「自由エネルギー解析に基づくウレアーゼ阻害能の定量的評価」
2022/06/09	日本蛋白質科学会若手奨励賞
2022/03/24	教員表彰（研究および社会貢献）
全件表示（7件）

教育上の能力

●その他教育活動上特記すべき事項

2021/10/17 ～ 2021/10/17	グローバルサイエンスキャンパス広島　ステップステージ（タイトルは公開講座の欄参照）

社会における活動
2024/03/19 ～ 2024/03/19	令和5年度　広島県立広島国泰寺高等学校　課題研究成果発表会
2023/02/13 ～ 2023/02/13	令和4年度広島県科学セミナー第3回科学セミナー　審査委員
2021/04 ～ 2021/11	第44回日本生体医工学会中国四国支部大会実行委員
2019/04 ～ 2019/10	日本コンピュータ化学会2019年秋季年会実行委員
2014/04 ～ 2014/11	The 1st International Symposium on Interactive Materials Science Cadet Program, committee member

所属学会
2022	日本蛋白質科学会
2015	理論化学研究会
2007/03	日本化学会
2007	分子科学会

公開講座
2024/08/04	オープンキャンパス　「生体情報の計測と処理を通してヘルスケアの基礎に触れよう」
2024/07/12	模擬授業　「シミュレーションとAIを使って化学と生物学に挑む」広島市立広島中等教育学校講座種別：その他
2023/08	ひろしま医工学スクール　ハンズオンチュートリアル「コンピュータを使った医薬品設計」講座種別：公開講座
2023/06	模擬授業　「シミュレーションやAIを使った医薬品評価」広島市立沼田高等学校講座種別：その他
2023/03	ひろしま医工学スクール　ハンズオンチュートリアル「コンピュータを使った医薬品設計」講座種別：公開講座
全件表示（22件）